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Prototypische Umsetzung einer Applikation zur Aufbereitung und Visualisierung von Ausbrüchen multiresistenter Erreger (MRE)

Thema:
Prototypische Umsetzung einer Applikation zur Aufbereitung und Visualisierung von Ausbrüchen multiresistenter Erreger (MRE)
Art:
MA
BetreuerIn:
Christian Wolff
BearbeiterIn:
Johannes Hoffmann
ErstgutachterIn:
Christian Wolff
ZweitgutachterIn:
Udo Kruschwitz
Status:
in Bearbeitung
angelegt:
2023-06-19
Antrittsvortrag:
2023-07-10
Abschlussvortrag:
2023-12-04

Hintergrund

Erkennen von Transmissionsereignissen von multiresistenten Keimen, insbesondere von vancomycinresistenten Enterokokken, ist eine der wichtigsten Aufgaben der Krankenhaushygiene. Anders als in der Mehrheit der anderen deutschen Krankenhäuser steht am Universitätsklinikum Regensburg der Abteilung Krankenhaushygiene und Infektiologie inzwischen mit der Möglichkeit der Sequenzierung der DNA der entsprechenden Keime ein Mittel zur Verfügung. So können sich hier mit großer Genauigkeit wahrscheinliche Transmission erkennen lassen. Die Daten aus der Sequenzierung sind allerdings nur aussagekräftig, wenn auch ein zeitlicher und räumlicher Zusammenhang zwischen den Patienten, bei denen die Sequenzierung eine Übertragung vorhersagt, nachgewiesen werden kann. Dies erfolgt momentan über sogenannte LineLists, in denen die Aufenthalte auf den Stationen (Station, Zimmer, Bettplatz) der entsprechenden Patienten chronologisch mit der Hand eingetragen und verglichen wird.

Zielsetzung der Arbeit

Ziel des Projektes ist es, die Bewegungsdaten der betrachteten Patienten nach möglichen Kontakten zu analysieren und in Kombination mit den Ergebnissen aus der Sequenzierung in einem interaktiven Tool zu visualisieren. So sollen mögliche Transmissionswege aufgezeigt werden können. Damit könnte eine wesentliche Erleichterung bei der Ausbruchsaufklärung erreicht werden, insbesondere da damit auch größere Zeiträume und auch länger zurückliegenden Krankenhausaufenthalte berücksichtigt werden könnten, als das momentan bei der nicht-digitalen Auswertung der Fall ist.

Anmerkung: Die Implementation eines solchen Tools muss aufgrund der Sensibilität der Daten für die Kliniknetz-Rechner des Uniklinikums (keine Internetverbindung, normalerweise Windows 10 oder Ubuntu) erfolgen. Es besteht zumindest die theoretische Möglichkeit, innerhalb des Kliniknetzes Server bereitzustellen, weshalb sich die Implementation als gedockerter Webserver anbietet, der entweder lokal oder über einen solchen Server innerhalb des Netzes betrieben werden kann.

Konkrete Aufgaben

Erwartete Vorkenntnisse

Weiterführende Quellen